日本の秘境100選は、JTBが雑誌「旅」の創刊750号記念のシンポジウムにおいて1989年に選定されたものです。岡田喜秋、C・W・ニコル、立松和平、辺見じゅん、椎名誠が選定に参加し、「いま 日本の秘境100選」と称されました。
秘境は多くの人に知られてしまうと、開発が進み観光地が著しくなり、秘境たるゆえんを失ってしまいます。皆に来てほしくはないが、その素晴らしさを多くに知らせたい、というある意味、矛盾した思いで選ばれたことでしょう。
全都道府県から平等に選出されているのではなく、千葉県、神奈川県、愛知県、大阪府、山口県、福岡県からは選ばれていません。こうしてみると都市圏として栄えているところが選ばれにくいようです。東京都からは二ヶ所が選出されているものの、小笠原、青ヶ島といずれも本土からは遠く離れた島々です。
選ばれたスポットの中にはアクセスが極端に難しいものもありますので、訪れる際には十分な下調べと準備を怠らないようにしたいものですね。
北海道・東北
北海道
礼文島（Wikipedia）
大雪山（Wikipedia）
北オホーツク海岸（Wikipedia）
知床（Wikipedia）
野付半島（Wikipedia）
釧路湿原（Wikipedia）
然別湖（Wikipedia）・東雲湖（Wikipedia）
渡島半島（Wikipedia）
サロベツ原野（Wikipedia）
オンネトー（Wikipedia）
積丹半島西岸（Wikipedia）
青森県
八甲田山（Wikipedia）
下北半島（Wikipedia）／恐山（Wikipedia）・仏ヶ浦（Wikipedia）
津軽半島西岸（Wikipedia）
十二湖（Wikipedia）・白神山地（Wikipedia）
岩手県
八幡平（Wikipedia）・乳頭温泉郷（Wikipedia）
遠野盆地（Wikipedia）
内間木洞（Wikipedia）
重茂半島（Wikipedia）
宮城県
笹谷峠（Wikipedia）
秋田県
八幡平（Wikipedia）・乳頭温泉郷（Wikipedia）
山形県
出羽三山（Wikipedia）
飛島（Wikipedia）
笹谷峠（Wikipedia）
福島県
檜枝岐（Wikipedia）・野岩鉄道沿線（Wikipedia）
裏磐梯（Wikipedia）・雄国沼（Wikipedia）
尾瀬（Wikipedia）
関東
茨城県
奥久慈（観光協会）
栃木県
檜枝岐（Wikipedia）・野岩鉄道沿線（Wikipedia）
奥鬼怒（Wikipedia）
奥日光（Wikipedia）
足尾銅山跡（Wikipedia）
奥那須（那須町観光協会・黒磯観光協会）
群馬県
埼玉県
千葉県
n/a
東京都
神奈川県
n/a
北陸・甲信越
新潟県
佐渡（Wikipedia）・外海府（Wikipedia）
秋山郷（Wikipedia）
尾瀬（Wikipedia）
上路の里（Wikipedia）
鍋倉山（信州いいやま観光局・Yamakei Online）
富山県
黒部峡谷（Wikipedia）
五箇山（Wikipedia）・白川郷（Wikipedia）
八尾の里（越中八尾観光協会）
・富山市観光協会）
石川県
能登外浦海岸（Wikipedia）
白山北麓（Wikipedia）
福井県
山梨県
青木ヶ原樹海（Wikipedia）
西沢渓谷（Wikipedia）
大菩薩峠（Wikipedia）
長野県
上高地（Wikipedia）
秋山郷（Wikipedia）
遠山郷（Wikipedia）
木曽路（Wikipedia・木曽観光連盟）
奥裾花（Wikipedia）
鍋倉山（信州いいやま観光局・Yamakei Online）
野麦峠（Wikipedia）
東海・近畿
静岡県
寸又峡（Wikipedia）・大井川源流（Wikipedia）
柿田川（Wikipedia）
中伊豆（伊豆市観光協会中伊豆支部）／猫越峠（コトバンク）
桶ヶ谷沼（Wikipedia）
岐阜県
五箇山（Wikipedia）・白川郷（Wikipedia）
長良川上流（Wikipedia）
岩村城跡（Wikipedia）
野麦峠（Wikipedia）
愛知県
n/a
三重県
大台ケ原（Wikipedia）／大杉谷（Wikipedia）
神島（Wikipedia）
滋賀県
琵琶湖（Wikipedia）／竹生島（Wikipedia）
石楠花渓（日野観光協会）
京都府
蛭子山古墳（Wikipedia）・作山古墳（Wikipedia）
芦生原生林（Wikipedia）
大阪府
n/a
兵庫県
瀞川渓谷（Wikipedia）
奈良県
十津川郷（Wikipedia）
大台ケ原（Wikipedia）／大杉谷（Wikipedia）
和歌山県
熊野古道（Wikipedia）
古座川（Wikipedia）
裏高野（高野町観光協会）
中国・四国
鳥取県
氷ノ山西麓（Wikipedia）
島根県
島根半島北岸（Wikipedia）
岡山県
鯉ヶ窪湿原（Wikipedia）
広島県
比婆山（Wikipedia）
引き明けの森（Wikipedia）
宮島（Wikipedia）
山口県
n/a
徳島県
祖谷（Wikipedia）
香川県
小豆島（Wikipedia）
愛媛県
佐田岬（Wikipedia）
別子銅山跡（Wikipedia）
高知県
四万十川（Wikipedia）
千本山（Wikipedia）
野根山街道（Wikipedia）
大堂海岸（Wikipedia）
奥物部（四国ツーリズム創造機構）
九州・沖縄
福岡県
n/a
佐賀県
吉野ヶ里遺跡（Wikipedia）
長崎県
五島列島（Wikipedia）／嵯峨ノ島（Wikipedia）
鷹島海底遺跡（Wikipedia）
熊本県
大分県
坊がつる（Wikipedia）
国東半島（Wikipedia）／六郷満山（Wikipedia）
宮崎県
高千穂の里（Wikipedia）
椎葉の里（Wikipedia）
銀鏡（Wikipedia）
鹿児島県
吐噶喇列島（Wikipedia）
屋久島原生林（Wikipedia）
竹島（Wikipedia）・黒島（Wikipedia）・硫黄島（Wikipedia）
沖縄県
西表島（Wikipedia）
石垣島（Wikipedia）・竹富島（Wikipedia）
与那国島（Wikipedia）